因为善良之神与邪恶之神转世、更迭,神界内部矛盾逐渐升级,以毁灭之神为首的一众神祇向以海神、修罗神为首的另一众掌权神祇发起了战争。而就在这个时候,同时掌控海神、修罗神两大神祇之位的神界执法者唐三的妻子小舞却怀孕了。神界的危机由此升起,唐三预感,除了神界内部矛盾之外,还有巨大危机即将到来,这危机又是什么呢?神界传说,是拙作斗罗大陆II绝世唐门之后,一部承上启下的神界故事,在这里,大家会看到很多熟悉的身影。同时,这一部神界传说,也将是未来斗罗大陆III的前传。
大体是先介绍了初代七怪的情况,但因为毁灭之神的心急,导致神界力量难以对抗突如其来的时间洪流。在这个时候,金龙王作祟,让神界卷入黑洞
神界,因为上代善良之神与上代邪恶之神转世到人间体验生活,将神界中枢交给兼具海神与修罗神神位的唐三管理。而同为至高神的毁灭之神因为不服唐三的管理而带领手下的七原罪神发起叛乱。他让手下的破坏神绑架了唐三怀孕的妻子小舞,从而使唐三妥协,但唐三告诉毁灭之神神界的大灾难即将来临。唐三让自己的女婿情绪之神戴雨浩找到毁灭之神的妻子生命女神,并且告诉她毁灭之神用了神禁之地的力量来封印唐三,从而使生命女神加入到唐三一方。来到神禁之地后,小舞成功分娩,生下一个男孩并取名为唐舞麟。但在混战中,因为戴雨浩使用了雨浩三绝,使生命女神回忆起她与毁灭之神的爱情,于是生命女神只能中立。因为破坏神的临阵倒戈而使七原罪之一被俘,结果让唐三一方赢得胜利。就在这时,神界巨变,唐三发现了能让神界毁灭的时空乱流正从宇宙中向神界飞去。为了抵御时空乱流的袭击,毁灭之神与生命女神献出了生命,才勉强抵御住时空乱流的攻击。这时,神禁之地的封印破碎,远古叛乱的神兽金龙王冲出,却被合力击败。为了破坏抵挡时空乱流的神界中枢,金龙王将它的神核打入了唐舞麟体内,想要让其成为人肉炸弹。为了保住儿子的性命,唐三将儿子送到了斗罗大陆。就在这时,神界中枢终于抵挡不住时空乱流,被卷到了未知的地方……斗罗大陆,人类的魂导器已经发展到了极高的水平,魂兽即将灭绝。星斗大森林里的“主上”苏醒了,唐舞麟也被人收养了,神界却被时空乱流卷走,他们将何去何从?